Công ty tôi đang giao dịch xuất bán hàng hóa cho khách hàng (tổ chức) nước ngoài có hiện diện tại Việt Nam và được khách hàng nước ngoài chỉ định giao hàng hóa đến bên gia công là doanh nghiệp khác tại Việt Nam.

Theo hướng dẫn từ Chi cục Hải quan Nhơn Trạch, từ ngày 20/7/2023 trở đi, trường hợp này công ty không được thực hiện thủ tục xuất nhập khẩu tại chỗ như trước đây nữa nhưng phải thực hiện thủ tục hải quan thông qua kho ngoại quan. Công ty đã tuân thủ quy định bằng việc thông báo với khách hàng nước ngoài để thuê kho ngoại quan và làm thủ tục hải quan thông qua kho ngoại quan.

Tuy nhiên, đến ngày 17/2/2025, Bộ Tài chính ban hành Công văn số 1872/BTC-TCT gửi Ủy ban nhân dân tỉnh Đồng Nai về chính sách thuế GTGT, trích dẫn một đoạn của công văn như sau:

“Trường hợp doanh nghiệp nội địa bán hàng hóa cho thương nhân nước ngoài có hiện diện tại Việt Nam và được chỉ định giao hàng cho bên thứ ba là doanh nghiệp Việt Nam thông qua kho ngoại quan không đáp ứng được điều kiện hàng hóa xuất khẩu bán cho tổ chức, cá nhân ở nước ngoài và tiêu dùng ở ngoài Việt Nam, hàng hóa bán cho tổ chức, cá nhân trong khu phi thuế quan và tiêu dùng trong khu phi thuế quan không thuộc trường hợp hàng hóa xuất khẩu áp dụng thuế suất 0% theo quy định tại khoản 1 Điều 9 Thông tư số 219/2013/TT-BTC nêu trên”.

Theo tôi hiểu, cơ quan hải quan đã hướng dẫn công ty làm thủ tục xuất khẩu qua kho ngoại quan nhưng bây giờ cục thuế không chấp nhận giao dịch đó là doanh thu xuất khẩu mà phải xử lý như doanh nghiệp nội địa phải chịu thuế GTGT 8%. Vấn đề này là sự không thống nhất giữa các cơ quan chức năng gây khó khăn cho doanh nghiệp. Nếu xử lý theo công văn của Bộ Tài chính, công ty tôi tiếp tục mất 12 tỷ tiền thuế GTGT không được hoàn. Việc này gây bức xúc cho nhà đầu tư rất nhiều. Vấn đề này không phải chỉ công ty tôi đang gặp phải mà rất nhiều công ty nước ngoài khác đang vướng mắc mà không nhận được hướng dẫn cụ thể để thực thi.

Công ty tôi muốn xuất hóa đơn GTGT cho tặng cho khách hàng ở nước ngoài bằng tiền USD với thuế suất 8% theo doanh thu nội địa nhưng e ngại không đúng theo quy định thu ngoại tệ của ngân hàng nhà nước.

Hiện công ty tôi không biết giải quyết thế nào để có thể bán hàng được cho khách vì mở tờ khai xuất khẩu thì cũng không được mà xuất hóa đơn GTGT bằng USD có thuế 8% cũng không được.